RNA甲基化修饰(m6A)课题思路介绍及热点方向分析
2022年4月30-5月1号/线上授课可回放复习
作为近年来CNS期刊的热点和国自然的热门,RNA的表观遗传学研究受到很高的重视,其中最具代表的是N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A),即发生在RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上发生甲基化修饰。与m6A相关的论文发表数量近年来显著升高,且以CNS期刊为代表的高分值文章比例非常高(图1)。
研究发现,作为基因转录及转录后调控的重要作用方式,m6A修饰参与调节生物体中多种生物学过程,与多种疾病发生、发育具有显著相关。m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。m6A除了分布在mRNA中,也出现在很多非编码RNA中,如:环状RNA、LncRNA等。
国家自然基金支持情况既代表国家宏观层面对学术研究的导向性,也可以反映出当前学术研究的热点方向,我们以国家自然科学基金中标项目分析m6A甲基化研究。调查发现(图2)在2009年-2016年间,以m6A甲基化研究的标书年均中标数量在3-6项左右,这一数字在2017年增长为22项,增长近4倍;而2018年,m6A甲基化中标项目激增至65项,比2017年又提高了近3倍;与2016年相比,2018年的增长倍数超过了10倍。同时,从中标金额角度来看,2016年中标金额为260万元,到2017年则增长为1038万,同样增长了4倍;2018年的中标金额则达到了2915万元,比2017年增长了近3倍。
在2年时间内可以达到国自然中标数以及中标金额均增长超过10倍,且可以预期未来其仍然会有进一步增长,这表明了m6A甲基化领域是一个增长迅速、增长势头强的新兴领域。
从研究领域来讲(图3),从2009年到2018年间,m6A甲基化研究与肿瘤相关研究项目达到40项,占所有m6A甲基化研究项目的47%;其次为遗传学、分子生物学等基础学科。这一学科比例分步也体现出m6A甲基化研究在肿瘤研究中的重要意义,也是我们公司选择MeRIP-seq与RNA-seq数据整合分析在肿瘤相关研究的定位依据。
以上结果看着非常喜人,但是在具体的实施过程中,就会面对很多现实的问题需要取舍。比如:
1.哪些疾病或者研究方向可以设计与m6A修饰的相关研究?
2. 测序费用比较贵,怎么才能做得更有性价比,更有延伸性?
3.m6A测序和实验数据如何解读?具体试验分组该如何设置?测序后的实验如何延伸和开展?
4.m6A可以和哪些研究手段进行结合分析?
5.最新的非编码RNA中的m6A研究该如何开展等?
6. 除了常规的测序实验之外,m6A研究还能如何开展?
需要了解以上信息,在具体实验时才清楚如何设计课题,如何开展试验。鉴于此我们特别邀请到在此方面经验丰富的专家老师通过两天的会议给您理清相关思路,补充相关知识。
导师介绍:
本次课程主讲老师来自中科院,长期专注于表观遗传学等方面研究,对m6A方向的科研思路以及最新研究动态熟悉掌握。从事相关科研课题设计工作多年,发表论文40余篇,其中10分以上5篇,主持和参与国自然基金项目5项,其中m6A课题相关的4项。主讲老师多次应邀为大学、医院、科研单位进行相关主题讲座指导,具有丰富的课题设计和执行经验,并多次受邀在国际大会上发言,对m6A相关的RIP测序、涉及非编码RNA的m6A调控机制等相关方向有深刻了解,且具有丰富讲课经验表达能力,本课程内容为原创设计属于国内创新,通过两天的课程一定能让您对RNA表观遗传学方面的课题设计及研究执行有很好的理解。
培训重点:
通过整整两天的学习,了解RNA甲基化修饰(主要是m6A)相关研究的实验设计思路及具体注意事项,可以更加有效的进行m6A相关课题的研究;了解m6A最新研究进展,强调在非编码RNA(miRNA和LncRNA)中的m6A调控关系;了解meRIP-seq测序的整合分析思路以及测序报告解读;meRIP-seq测序后续实验思路开展及课题延伸。
培训目标:
1.了解m6A修饰相关研究的疾病类型及具体调控机制。
2.了解meRIP-seq测序方法以及后续研究思路的延伸。
3.掌握m6A修饰相关国自然标书研究思路的总结及写作重点。
培训大纲:
时间安排 | 课程表 | 介绍 |
第一天 | 8:30~10:00 | RNA甲基化的概念及研究的意义 | RNA甲基化的概念及甲基化类型; RNA甲基化的调控机制及生物学功能; |
10:20~12:00 | M6a相关方案设计方法 | M6a甲基化的研究现状; 常见研究思路及方案设计注意事项; |
13:30~15:00 | RIP测序及应用 | 测序技术流程介绍; 测序报告的导读; |
15:20~17:00 | 测序的后续延伸及数据整合 | M6a测序后的项目延伸及多组学整合; |
第二天 | 8:30~10:00 | RNA甲基化项目国自然思路概述及标书分析 | RNA甲基化相关国自然课题的介绍及趋势统计; 国自然标书写作思路介绍; |
10:20~12:00 | RNA甲基化高分思路延伸 | MeRIP测序及RNA-seq整合分析; 非编码RNA的甲基化分析(miRNA/lncRNA等) |
13:30~15:00 | 案例解读及思路分析 | 高分文献思路示例及总结; |
15:20~16:30 | 讨论环节 | 讨论及个性化问题答疑; |
【注意事项】此次课程为线上直播教学模式(腾讯会议平台授课非录播可互动),报名付费成功后,会务组将在开班前3天左右发给您电子版课件资料。参加的学员课后可通过微信群继续同授课老师交流,长期获得指导机会。
【报名费】:2800/人(可开具发票,费用包含电子版材料)
【付款账号】
1.银行汇款户名:
上海科贛信息科技中心(汇款时请注意账户名“贛”gàn 字 繁体字)
账 号:03303400040063876
开户行:农业银行上海定西路支行
2.支付宝:17269437589(实名唐瑶瑶/上海科贛信息科技中心)
3.公务卡/信用卡请联系唐
【欢迎咨询】唐老师:172 6943 7589(微信同号)确定参加请加唐老师微信以便邀请入学员群
【报名方法】
学员请通过以下在线提交报名,收到您的报名信息后将及时电话/微信与您联系
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