国自然研究热点肿瘤免疫浸润相关数据库和工具使用-生信技能实战课
时间：3.12-3.13
线上直播，赠送回放视频，长期答疑群
报名方式请下拉至文末
学习背景介绍
近期“肿瘤微环境、免疫浸润分析”相关研究不仅在论文发表上，发表数量逐年递增。从近年的国家自然科学基金资助的项目数和总金额来看，肿瘤微环境和免疫方向相关立项也是节节攀升，反映了这一研究领域的重要性。
肿瘤微环境主要由肿瘤细胞、成纤维细胞、免疫细胞、各种信号分子和细胞外基质及特殊的理化特征等共同组成，肿瘤微环境显著影响着肿瘤的诊断、生存结局和临床治疗敏感性。
通过发挥促肿瘤作用和抗肿瘤作用，浸润肿瘤的免疫细胞可以深刻影响肿瘤的进展以及抗癌治疗的成功。因此，肿瘤浸润免疫细胞的量化有望揭示免疫系统在人类癌症中的多方面作用，并参与肿瘤逃逸机制和对治疗的反应。
因此免疫浸润也是近几年肿瘤研究的一个重要方向。目前也有一些比较方便的工具帮助大家挖掘免疫浸润，如CIBERSORT等。
那么到底热门文献中免疫浸润分析是什么样的？我们自己能不能做得出来？免疫浸润分析的相关工具和数据库到底有哪些，又该如何使用？
《肿瘤微环境和免疫浸润分析-生信技能课程》将带领大家逐一对相关的工具和数据库进行学习，希望大家学习之后对免疫浸润分析有更深刻的了解，基本能够满足论文和基金中对于免疫浸润分析的需求。
学习目的与预期
1、主流免疫浸润分析数据库（IMMUPORT、TISIDB、TIMER等）的熟悉掌握。
2、主流免疫浸润分析工具（CIBERSORT、ESTIMATE、xCELL等）的熟悉掌握。
3、掌握复现高分文献中免疫浸润相关展示图表的能力。
4、能够满足日常文章以及国自然基金免疫浸润分析相关图表的制作。
讲师介绍
宋老师，从事生信分析工作多年，参与并完成了超过百个软件著作权和发明专利的撰写和申请，参与超过近三百个项目的设计、开发、分析环节。
研究方向：擅长GEO、TCGA数据挖掘；转录组、代谢组，蛋白组，16S等二代测序标准分析和定制化高级分析；长期专注于肿瘤方向生物信息数据分析，精通R语言以及各类生物信息学软件。
主要培训方向：《GEO数据挖掘》、《TCGA数据库挖掘和应用》、《网络药理学分析》、《肠道微生物相关分析》等
会议安排
时间安排 | 主要内容 |
第一天 9.00-10.10 | 1、肿瘤免疫浸润高分生信文献梳理； 2、免疫浸润知识介绍并梳理文献的关键图表； |
第一天 10.20-11.30 | 实操课： 1、TISIDB免疫学数据库的介绍和使用 2、IMMUPORT免疫数据库的介绍和使用 |
第一天14.00-15.10 | 实操课：免疫细胞浸润估计工具CIBERSORT实操（包括原理，数据准备，实操，结果可视化以及结果解读） |
第一天15.20-16.30 | 实操课：ssGSEA样本基因集富集分析实操（原理，数据准备，操作和结果解读） |
第二天 9.00-10.10 | 实操课：肿瘤免疫工具TIMER的实操以及结果解读 |
第二天 10.20-11.30 | 实操课：肿瘤纯度算法工具ESTIMATE的实操以及结果解读 |
第二天14.00-15.10 | 实操课： 1、肿瘤免疫浸润分析工具EPIC使用 2、肿瘤免疫浸润分析工具xCELL使用 |
第二天15.20-16.30 | 课程成果检测：3-5分左右纯生信文献涉及免疫浸润部分的结果复现实操。提供整理数据。 |
【注意事项】此次课程为线上直播教学模式（腾讯会议平台授课非录播可互动），报名付费成功后，会务组将在开班前3天左右发给您电子版课件资料。参加的学员课后可通过微信群继续同授课老师交流，长期获得指导机会。
【学习对象】从事生物、医学、等相关领域，需要撰写及申请科研基金的科研人员及在校师生均可参加。
【注册费用】3200/人，三人或以上一同报名，即可享受团队优惠，在原价格基础上各减免300元。提前确认报名及付款的，可以提前拿到学习材料；提供纸质版盖章会议通知和正式发票（纸质发票或电子发票）用于报销，如提前需要请联系
【付款账号】
1.银行汇款户名：
上海科贛信息科技中心(汇款时请注意账户名“贛”gàn 字 繁体字）
账 号：03303400040063876
开户行：农业银行上海定西路支行
2.支付宝：17269437589（实名唐瑶瑶/上海科贛信息科技中心）
3.公务卡/信用卡请联系唐
【欢迎咨询】唐老师：172 6943 7589（微信同号）确定参加请加唐老师微信以便邀请入学员群
【报名方法】
学员请通过以下在线提交报名，收到您的报名信息后将及时电话/微信与您联系
【点击在线报名】